PREDAVANJA ODRŽANA U ORGANIZACIJI HRVATSKOG BIOFIZIČKOG DRUŠTVA U 2004.

PREDAVAČ	NASLOV/SAŽETAK	DATUM, VRIJEME I MJESTO
mr.sc. Larisa Zoranić Fakultet prirodoslovno-matematičkih znanosti i odgojnih područja, Split	PREDIKTOR SPLIT Od aminokiselinskog slijeda do sekundarne strukture Kako predvidjeti trodimenzionalnu strukturu proteina, ako je poznat samo aminokiselinski slijed, jedno je od najvećih današnjih znanstvenih izazova. Informacijska tehnologija, tj. bioinformatika, razvila je alate koji bi mogli dovesti do rješenja ovog problema. Međutim, poteškoće kao što su velik broj ne-klasificiranih bioloških podataka zajedno s malim brojem kristalografski poznatih 3D struktura ograničavaju bioinformatička istraživanja i naglašavaju potrebu za strogom kontrolom dobivenih rezultata. Ovo posebno vrijedi za integralne membranske proteine čija je velika medicinska i biološka važnost u nesrazmjeru s malim broj poznatih trodimenzionalnih struktura. Na primjeru prvog hrvatskog bioinformatičkog poslužitelja SPLIT (http://split.pmfst.hr/split/) opisat će se način razvijanja bioinformatičkih alata. Program SPLIT modeliranjem hidrofobnosti ili statističkih sklonosti aminokiselinskih ostataka predviđa transmembranske domene integralnih membranskih proteina. Osnova predviđanja su konformacijski profili izračunati preko sklonosnih funkcija. Usporedba algoritama s već priznatim bioinformatičkim alatima pokazala je da je program SPLIT u samom vrhu skupine najboljih prediktora transmembranskih domena u svijetu.	ponedjeljak, 13. prosinca u 16:00 sati, predavaonica u I krilu Instituta Ruđer Bošković
prof. Sebastian Seung Massachusetts Institute of Technology Cambridge, Massachusetts, USA Kolokvij Seminara za teoriju odlučivanja i Hrvatskog biofizičkog društva	Learning the parts of objects by nonnegative matrix factorization	utorak, 7. prosinca 2004. u 16 sati, predavaonica 108 (1. kat), PMF-Matematički odjel, Bijenička 30
prof Rudi Podgornik Faculty of Mathematics and Physics University of Ljubljana Jadranska 19 SI-1000 Ljubljana Slovenia	The physics of DNA Sažetak: I will describe a slew of physical problems connected with DNA in various contexts. I will introduce the equation of state of DNA, the phase diagram of DNA and the nature of the condensed mesophases it makes, the DNA-DNA interactions and elasticity of DNA. For each of the problems I will explain the physical context and discuss its ramifications.	četvrtak, 21. listopada 2004. u 14:00 sati u predavaonici III krila Instituta za fiziku, Bijenička 46
Dr. Marija Vrljić Stanford University USA Kolokvij Hrvatskog biofizičkog društva i Grupe za lipoproteine	Translacijska difuzija MHC proteina razreda II u staničnoj membrani Sažetak: Strukture stanične membrane pri različitim koncentracijama kolesterola istraživana je pomoću single-molecule epifluorescence mikroskopije. Translacijska difuzija single-kopija transmembranske i lipidno (GPI)-vezane bjelancevine MHC razreda II, I-Ek, korištena je kao pokazatelj promjena u strukturi stanične membrane. Pri svim koncentracijama kolesterola difuzija gore navedenih molekula može se opisati Brown-ovim gibanjem.	21. siječnja 2004. u 12 sati, predavaonica III. krila Instituta Ruđer Bošković